Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GEN1Q17RS7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GEN1Q17RS7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GEN1Q17RS7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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