Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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