Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPP1Q16831 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPP1Q16831 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPP1Q16831 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms