Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTN1Q16799 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN1Q16799 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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