Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FOXD1Q16676 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FOXD1Q16676 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FOXD1Q16676 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
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