Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ECM1Q16610 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ECM1Q16610 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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