Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPC1Q16533 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPC1Q16533 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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