Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPE65Q16518 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPE65Q16518 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms