Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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