Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA1EQ15878 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA1EQ15878 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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