Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGN3Q15651 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HMGN3Q15651 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms