Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBE3CQ15386 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE3CQ15386 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE3CQ15386 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms