Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF1Q15361 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTF1Q15361 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms