Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT31Q15323 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT31Q15323 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms