Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDK3Q15120 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PDK3Q15120 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PDK3Q15120 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDK3Q15120 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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