Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EBI3Q14213 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EBI3Q14213 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms