Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCARB2Q14108 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARB2Q14108 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARB2Q14108 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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