Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPSQ13938 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPSQ13938 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms