Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA5AQ13591 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA5AQ13591 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms