Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf61Q13536 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf61Q13536 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf61Q13536 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf61Q13536 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf61Q13536 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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