Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRPC3Q13507 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC3Q13507 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms