Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCIRG1Q13488 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCIRG1Q13488 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCIRG1Q13488 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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