Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XRCC4Q13426 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XRCC4Q13426 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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