Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSLNQ13421 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSLNQ13421 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms