Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3BPQ13352 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3BPQ13352 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3BPQ13352 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms