Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF1Q13077 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAF1Q13077 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF1Q13077 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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