Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TBCE-206ENST00000482230 1050 ntTSL 515.03■□□□□ -01e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 TBCE-205ENST00000472011 1840 ntTSL 213.51□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 WDR45B-204ENST00000571835 869 ntTSL 58.74□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.014e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.314e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.454e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 GK-210ENST00000481024 2401 ntTSL 212.07□□□□□ -0.484e-8■■■■□ 23.1
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ILF3Q12906 SPPL3-204ENST00000536996 763 ntTSL 514.25□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SPPL3-206ENST00000543181 663 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 CDK6-204ENST00000473078 386 ntTSL 21.54□□□□□ -2.168e-13■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 LIMS1-208ENST00000428064 637 ntTSL 220.96■□□□□ 0.951e-9■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-9■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 PARN-212ENST00000564882 452 ntTSL 37.18□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 23
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ILF3Q12906 TMEM241-202ENST00000460322 889 ntTSL 521.46■■□□□ 1.034e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 TMEM241-206ENST00000482411 667 ntTSL 520.48■□□□□ 0.874e-6■■■■□ 23
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ILF3Q12906 TMEM241-213ENST00000580025 571 ntTSL 419.08■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 23
ILF3Q12906 TMEM241-215ENST00000582336 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.67■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 23
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ILF3Q12906 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-6■■■■□ 23
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ILF3Q12906 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.763e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.553e-9■■■■□ 23
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ILF3Q12906 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.473e-9■■■■□ 23
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ILF3Q12906 SEPT2-216ENST00000434955 480 ntTSL 323.02■■□□□ 1.285e-9■■■■□ 23
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ILF3Q12906 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-224ENST00000457335 570 ntTSL 410.52□□□□□ -0.735e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-212ENST00000425899 738 ntTSL 510.37□□□□□ -0.755e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-214ENST00000428524 644 ntTSL 59.93□□□□□ -0.825e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-230ENST00000467971 571 ntTSL 29.68□□□□□ -0.865e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.925e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-202ENST00000366210 672 ntTSL 38.2□□□□□ -1.15e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-219ENST00000441533 372 ntTSL 58.06□□□□□ -1.125e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-207ENST00000407017 650 ntTSL 47.65□□□□□ -1.185e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-221ENST00000445030 575 ntTSL 37.65□□□□□ -1.185e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-241ENST00000484740 563 ntTSL 35.84□□□□□ -1.475e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-220ENST00000443492 558 ntTSL 55.67□□□□□ -1.55e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-222ENST00000449239 599 ntTSL 24.88□□□□□ -1.635e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-228ENST00000464128 565 ntTSL 44.57□□□□□ -1.685e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-232ENST00000469434 583 ntTSL 34.15□□□□□ -1.755e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 SEPT2-233ENST00000473479 659 ntTSL 23.83□□□□□ -1.85e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.888e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 NCOR1-210ENST00000458113 3490 ntTSL 28.96□□□□□ -0.988e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 27.99□□□□□ -1.138e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.198e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 C8orf44-202ENST00000518860 732 ntTSL 35.23□□□□□ -1.573e-9■■■■□ 23
ILF3Q12906 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.738e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 FLNB-210ENST00000481470 6497 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.819e-11■■■■□ 23
ILF3Q12906 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.869e-11■■■■□ 23
ILF3Q12906 ANKRD17-206ENST00000514252 3259 ntTSL 25.04□□□□□ -1.68e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 TNFRSF10A-203ENST00000524158 693 ntTSL 516.36■□□□□ 0.217e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.097e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.297e-8■■■■□ 23
ILF3Q12906 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 23
ILF3Q12906 MKRN3-204ENST00000568945 2740 ntTSL 49.97□□□□□ -0.812e-7■■■■□ 23
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