Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TWF1Q12792 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWF1Q12792 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms