Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RRP42YDL111C 798 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YIP1YGR172C 747 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 VMA22YHR060W 546 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ZRT2YLR130C 1269 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ARC18YLR370C 537 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YOR387CYOR387C 621 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 CUR1YPR158W 759 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 DPM1YPR183W 804 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YBR113WYBR113W 483 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YFL042CYFL042C 2025 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 STT3YGL022W 2157 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 UBP7YIL156W 3216 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 PMT5YDL093W 2232 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 AZR1YGR224W 1842 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ELP4YPL101W 1371 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 VMS1YDR049W 1899 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 LAT1YNL071W 1449 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YDL177CYDL177C 513 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 snR8snR8 190 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YDR396WYDR396W 501 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SPG3YDR504C 384 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 VMA8YEL051W 771 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 RMD6YEL072W 696 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YIL077CYIL077C 963 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YIL175WYIL175W 318 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YAP5YIR018W 738 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YJL213WYJL213W 996 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YJR020WYJR020W 333 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YLR290CYLR290C 834 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ICY2YPL250C 411 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ATE1YGL017W 1512 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YMR018WYMR018W 1545 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 LSG1YGL099W 1923 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 HRP1YOL123W 1605 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 HTS1YPR033C 1641 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 RGI1YER067W 486 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YGL072CYGL072C 360 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 CDC12YHR107C 1224 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 RPL31BYLR406C 342 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 RAD33YML011C 534 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YMR310CYMR310C 954 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YNL035CYNL035C 1170 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 RPA49YNL248C 1248 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 PHO80YOL001W 882 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 BAP2YBR068C 1830 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 BZZ1YHR114W 1902 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ORC4YPR162C 1590 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 VPS5YOR069W 2028 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 MEC3YLR288C 1425 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 HXT17YNR072W 1695 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 TVP15YDR100W 432 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 CPD1YGR247W 720 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YJL160CYJL160C 864 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 HOC1YJR075W 1191 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SEN34YAR008W 828 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ARV1YLR242C 966 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 CUZ1YNL155W 825 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ARR2YPR200C 393 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ASN1YPR145W 1719 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 DPH2YKL191W 1605 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 DUG1YFR044C 1446 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 SNU56YDR240C 1479 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YOL036WYOL036W 2286 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YDL144CYDL144C 1071 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 DPP1YDR284C 870 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 BNA7YDR428C 786 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 MAG1YER142C 891 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 PAU5YFL020C 369 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 BER1YLR412W 825 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 PRX1YBL064C 786 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 MRP21YBL090W 534 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YOR053WYOR053W 342 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 APD1YBR151W 951 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 APM2YHL019C 1818 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 EMW1YNL313C 2715 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 PET494YNR045W 1470 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 FMP40YPL222W 2067 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 ECL1YGR146C 636 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 RPL17AYKL180W 555 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YLR294CYLR294C 330 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 CMR3YPR013C 954 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1A-DR3Q12441 YMR046CYMR046C 1323 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 SKN1YGR143W 2316 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 SPH1YLR313C 1593 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 APN2YBL019W 1563 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YDL071CYDL071C 375 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 RPL9AYGL147C 576 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 QNS1YHR074W 2145 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 YJL169WYJL169W 369 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 HIT1YJR055W 495 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 RNT1YMR239C 1416 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 PTK2YJR059W 2457 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-DR3Q12441 DSS1YMR287C 2910 nt5.63□□□□□ -1.51
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