Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 RPS11AYDR025W 471 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 SOH1YGL127C 384 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 SRP40YKR092C 1221 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 ATG3YNR007C 933 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 YPL168WYPL168W 1293 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 CBP3YPL215W 1008 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 VAC7YNL054W 3498 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 CDC14YFR028C 1656 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 snR70snR70 164 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 AYT1YLL063C 1425 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 SAC1YKL212W 1872 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 ARP4YJL081C 1470 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 CAJ1YER048C 1176 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 ICY1YMR195W 384 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 TFB2YPL122C 1542 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 ATG2YNL242W 4779 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 UBP1YDL122W 2430 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 ENA5YDR038C 3276 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 PAM18YLR008C 507 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 PEF1YGR058W 1008 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 TOM7YNL070W 183 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 GPI18YBR004C 1302 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 ESL2YKR096W 3588 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 RPS13YDR064W 456 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-GR3Q12316 HEF3YNL014W 3135 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 PRP22YER013W 3438 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 AFT1YGL071W 2073 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 SAW1YAL027W 786 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 SHH3YMR118C 591 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 WTM2YOR229W 1404 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 CHS2YBR038W 2892 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 TSC11YER093C 4293 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 KTR7YIL085C 1554 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 BCP1YDR361C 852 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 COX17YLL009C 210 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YPR050CYPR050C 414 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 RAX2YLR084C 3663 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YGR079WYGR079W 1113 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 KTI11YBL071W-A 249 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 UGA3YDL170W 1587 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YGR016WYGR016W 573 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 IDP2YLR174W 1239 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 OM14YBR230C 405 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YDR537CYDR537C 606 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 MDM34YGL219C 1380 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 SPP41YDR464W 4308 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 TRM44YPL030W 1704 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 PTP3YER075C 2787 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 CLB3YDL155W 1284 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YGR122WYGR122W 1209 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 CIN8YEL061C 3003 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 MPC54YOR177C 1395 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 BUD5YCR038C 1929 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 PEX1YKL197C 3132 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 RPL23AYBL087C 414 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 RPA135YPR010C 3612 nt4.34□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 ATG27YJL178C 816 nt4.34□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 YCL023CYCL023C 348 nt4.34□□□□□ -1.71
TY1B-GR3Q12316 NEW1YPL226W 3591 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 UBC1YDR177W 648 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 LSM12YHR121W 564 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YMR315WYMR315W 1050 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YOL019WYOL019W 1656 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 VPS17YOR132W 1656 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 STE11YLR362W 2154 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 PSF1YDR013W 627 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 CNL1YDR357C 369 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YHL005CYHL005C 393 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YAP5YIR018W 738 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 SMF1YOL122C 1728 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 CIT3YPR001W 1461 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YHR078WYHR078W 1659 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 PRR2YDL214C 2100 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YLR278CYLR278C 4026 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 SLD2YKL108W 1362 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YDR222WYDR222W 1248 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 JIP3YLR331C 378 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 OSW7YFR039C 1533 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YPR003CYPR003C 2265 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 SAP155YFR040W 3009 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 MGM101YJR144W 810 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 EMC6YLL014W 327 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 CUZ1YNL155W 825 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 TRS85YDR108W 2097 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 SWR1YDR334W 4545 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 GPI1YGR216C 1830 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 YFL051CYFL051C 483 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 MPS2YGL075C 1164 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 KAR4YCL055W 1008 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 SEC9YGR009C 1956 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 MIT1YEL007W 2001 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 RPL13AYDL082W 600 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 FAP7YDL166C 594 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 FYV5YCL058C 459 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 JJJ1YNL227C 1773 nt4.28□□□□□ -1.72
TY1B-GR3Q12316 TOS8YGL096W 831 nt4.27□□□□□ -1.73
TY1B-GR3Q12316 MPC3YGR243W 441 nt4.27□□□□□ -1.73
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