Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 YNL057WYNL057W 333 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 MFM1YPL060W 1242 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 ECM8YBR076W 1065 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 BSD2YBR290W 966 nt4.28□□□□□ -1.72
LSP1Q12230 RPO31YOR116C 4383 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 LPP1YDR503C 825 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 SPO73YER046W 432 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YER138W-AYER138W-A 105 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YHL026CYHL026C 948 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 SAE3YHR079C-A 276 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 FUR1YHR128W 651 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 CYC1YJR048W 330 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 TTI2YJR136C 1266 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YMR084WYMR084W 789 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RIM11YMR139W 1113 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 CTL1YMR180C 963 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YPL168WYPL168W 1293 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YBR134WYBR134W 402 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 TED1YIL039W 1422 nt4.27□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 DAS2YDR020C 699 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YGR219WYGR219W 342 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 SNL1YIL016W 480 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YKL071WYKL071W 771 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YLR049CYLR049C 1287 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 ELO3YLR372W 1038 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YLR462WYLR462W 609 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YMR178WYMR178W 825 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YOL166CYOL166C 339 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 AME1YBR211C 975 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 POF1YCL047C 777 nt4.26□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 PRP11YDL043C 801 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RPB7YDR404C 516 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 SDT1YGL224C 843 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YHB1YGR234W 1200 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 IGO2YHR132W-A 396 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 SMC3YJL074C 3693 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 IRC25YLR021W 540 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 CDC73YLR418C 1182 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YPT7YML001W 627 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 VPS71YML041C 843 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RSF1YMR030W 1131 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 TPP1YMR156C 717 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 SPS4YOR313C 1017 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 XRS2YDR369C 2565 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 TYW1YPL207W 2433 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 IME4YGL192W 1803 nt4.25□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 PHO12YHR215W 1404 nt4.24□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 PHO11YAR071W 1404 nt4.24□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YDR271CYDR271C 372 nt4.24□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RAD10YML095C 633 nt4.24□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 LDS2YOL047C 1071 nt4.24□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 MDL1YLR188W 2088 nt4.24□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 PMT4YJR143C 2289 nt4.24□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RRI1YDL216C 1323 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 HMS1YOR032C 1305 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YER077CYER077C 2067 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 BMS1YPL217C 3552 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 TAF8YML114C 1533 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 KAR5YMR065W 1515 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 TRP4YDR354W 1143 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 DID4YKL002W 699 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 EBP2YKL172W 1284 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 POL12YBL035C 2118 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 MRPS8YMR158W 468 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 MSD1YPL104W 1977 nt4.23□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RRN6YBL014C 2685 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 CLN2YPL256C 1638 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RPS8BYER102W 603 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 SPT4YGR063C 309 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 ANB1YJR047C 474 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 OAR1YKL055C 837 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 GAT3YLR013W 426 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 URA4YLR420W 1095 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 MTG1YMR097C 1104 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RPS8AYBL072C 603 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 NTA1YJR062C 1374 nt4.22□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 RTT109YLL002W 1311 nt4.21□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 TAF1YGR274C 3201 nt4.21□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 PHO87YCR037C 2772 nt4.21□□□□□ -1.73
LSP1Q12230 NUS1YDL193W 1128 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YGR079WYGR079W 1113 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 SEC65YML105C 822 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 SHH3YMR118C 591 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 RAD14YMR201C 1116 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 WRS1YOL097C 1299 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 GLO4YOR040W 858 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 TFB6YOR352W 1032 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 MRPL37YBR268W 318 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 FBP26YJL155C 1359 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 DIT2YDR402C 1470 nt4.21□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 MCD4YKL165C 2760 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 KRI1YNL308C 1776 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 ATG21YPL100W 1491 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YCR016WYCR016W 873 nt4.2□□□□□ -1.74
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