Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YLR407WYLR407W 687 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 UTP23YOR004W 765 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YDC1YPL087W 954 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 POF1YCL047C 777 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YKL050CYKL050C 2769 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 RTC1YOL138C 4026 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SWH1YAR042W 3567 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 OAF3YKR064W 2592 nt3.98□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 PAF1YBR279W 1338 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 EPO1YMR124W 2832 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 AIR1YIL079C 1083 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 ATG33YLR356W 594 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SPC24YMR117C 642 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 APE2YKL157W 2859 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 SYT1YPR095C 3681 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 IMH1YLR309C 2736 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 AVT7YIL088C 1473 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 NSP1YJL041W 2472 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 PGS1YCL004W 1566 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 UBP12YJL197W 3765 nt3.97□□□□□ -1.77
NFI1Q12216 MIC26YGR235C 702 nt3.96□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 POG1YIL122W 1056 nt3.96□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YIL171WYIL171W 330 nt3.96□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 FSH3YOR280C 801 nt3.96□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MSA1YOR066W 1890 nt3.96□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 CIT1YNR001C 1440 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MGR3YMR115W 1506 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 ELM1YKL048C 1923 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MGA1YGR249W 1371 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 NSE3YDR288W 912 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SEC72YLR292C 582 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SUI1YNL244C 327 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 TAF14YPL129W 735 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 LAS1YKR063C 1509 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SER3YER081W 1410 nt3.95□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 BYE1YKL005C 1785 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 BRE4YDL231C 3378 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RPL24AYGL031C 468 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MSA2YKR077W 1092 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 PNP1YLR209C 936 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RPP0YLR340W 939 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 HRT1YOL133W 366 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SNF8YPL002C 702 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MCM16YPR046W 546 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 FLO8YER109C 2400 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RAD26YJR035W 3258 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YOL019WYOL019W 1656 nt3.94□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 TPD3YAL016W 1908 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 ORC4YPR162C 1590 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 NRP1YDL167C 2160 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SEA4YBL104C 3117 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 DIT2YDR402C 1470 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YCL076WYCL076W 744 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 DPB4YDR121W 591 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 IRC6YFR043C 714 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 DUO1YGL061C 744 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YGR126WYGR126W 693 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MRPS35YGR165W 1038 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SOD1YJR104C 465 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YOR022CYOR022C 2148 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 TSR1YDL060W 2367 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SRP72YPL210C 1923 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MTH1YDR277C 1302 nt3.93□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 PMT6YGR199W 2280 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YIG1YPL201C 1386 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 KAP95YLR347C 2586 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SNF2YOR290C 5112 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 GRX6YDL010W 696 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SPR6YER115C 576 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YGR149WYGR149W 1299 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 CAB2YIL083C 1098 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 ECM15YBL001C 315 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RGS2YOR107W 930 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 ICY2YPL250C 411 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 FUN12YAL035W 3009 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 IMD4YML056C 1575 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YLR352WYLR352W 2424 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 TRM11YOL124C 1302 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 DAP2YHR028C 2457 nt3.92□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 ALG1YBR110W 1350 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RRN7YJL025W 1545 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SEC6YIL068C 2418 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YDL094CYDL094C 510 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 MRPL49YJL096W 486 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 RAD10YML095C 633 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 HEK2YBL032W 1146 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YBR016WYBR016W 387 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 ULP1YPL020C 1866 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 DSL1YNL258C 2265 nt3.91□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 SPT16YGL207W 3108 nt3.9□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 GCR1YPL075W 2358 nt3.9□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 CHL1YPL008W 2586 nt3.9□□□□□ -1.78
NFI1Q12216 YDR391CYDR391C 699 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 MIG3YER028C 1185 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YGL118CYGL118C 438 nt3.9□□□□□ -1.79
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