Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	PAF1	YBR279W	1338 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	PRP22	YER013W	3438 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	USA1	YML029W	2517 nt		3.61	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YHB1	YGR234W	1200 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	SNL1	YIL016W	480 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	TTI2	YJR136C	1266 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	MRP8	YKL142W	660 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	EMG1	YLR186W	759 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	MRPL3	YMR024W	1173 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YOL050C	YOL050C	321 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	CUS1	YMR240C	1311 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	ALE1	YOR175C	1860 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	ZDS2	YML109W	2829 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	UBP10	YNL186W	2379 nt		3.6	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	ERG5	YMR015C	1617 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	APP1	YNL094W	1764 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	MIG3	YER028C	1185 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	BMH1	YER177W	804 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	ARD1	YHR013C	717 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YIL086C	YIL086C	309 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	JLP1	YLL057C	1239 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	SPC3	YLR066W	555 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	SPC24	YMR117C	642 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	OSW1	YOR255W	837 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YDR098C-A	YDR098C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YDR210C-C	YDR210C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YDR261C-C	YDR261C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YDR316W-A	YDR316W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YDR365W-A	YDR365W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YER137C-A	YER137C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YER159C-A	YER159C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YGR027W-A	YGR027W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YGR038C-A	YGR038C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YGR161C-C	YGR161C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YJR026W	YJR026W	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YJR028W	YJR028W	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YAR010C	YAR010C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YLR157C-A	YLR157C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YLR227W-A	YLR227W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YLR256W-A	YLR256W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YML040W	YML040W	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YML045W-A	YML045W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YMR051C	YMR051C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YNL054W-A	YNL054W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YOL103W-A	YOL103W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YPL257W-A	YPL257W-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YPR137C-A	YPR137C-A	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	YPR158C-C	YPR158C-C	1323 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	PUS9	YDL036C	1389 nt		3.59	□□□□□ -1.83
VIK1	Q12045	IOC4	YMR044W	1428 nt		3.59	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	SMI1	YGR229C	1518 nt		3.59	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	SIP1	YDR422C	2448 nt		3.59	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YFT2	YDR319C	825 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YGR126W	YGR126W	693 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	RPS4B	YHR203C	786 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	RPS4A	YJR145C	786 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	TIS11	YLR136C	858 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YBL081W	YBL081W	1107 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	SUI3	YPL237W	858 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	FBP26	YJL155C	1359 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	PUB1	YNL016W	1362 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	CWH43	YCR017C	2862 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	IME4	YGL192W	1803 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	NOG1	YPL093W	1944 nt		3.58	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	TRX3	YCR083W	384 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	MAF1	YDR005C	1188 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	AIM7	YDR063W	450 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	TRP4	YDR354W	1143 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	MRP13	YGR084C	1020 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	SPO16	YHR153C	597 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	BAR1	YIL015W	1764 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	FAR8	YMR029C	1572 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	FDH2	YPL275W	711 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	SHE3	YBR130C	1278 nt		3.57	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	NPL4	YBR170C	1743 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	ARO80	YDR421W	2853 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	GPB1	YOR371C	2694 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	FAP7	YDL166C	594 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YDL228C	YDL228C	642 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	ECO1	YFR027W	846 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YPT7	YML001W	627 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	CPR3	YML078W	549 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	RNA1	YMR235C	1224 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	ATG8	YBL078C	354 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YOR338W	YOR338W	1092 nt		3.56	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YHL012W	YHL012W	1482 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	NAM9	YNL137C	1461 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	PRR2	YDL214C	2100 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	TYR1	YBR166C	1359 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YRB30	YGL164C	1323 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	AHA1	YDR214W	1053 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YNR042W	YNR042W	429 nt		3.55	□□□□□ -1.84

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