Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 ASI2YNL159C 870 nt4.33□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SPS4YOR313C 1017 nt4.33□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 CSH1YBR161W 1131 nt4.33□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 MRPL37YBR268W 318 nt4.33□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PHO87YCR037C 2772 nt4.33□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 OSH2YDL019C 3852 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 TAF12YDR145W 1620 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 MEF2YJL102W 2460 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 GAS4YOL132W 1416 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SSU1YPL092W 1377 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YDR290WYDR290W 330 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 OTU1YFL044C 906 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PEX14YGL153W 1026 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PRM9YAR031W 897 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 CUS2YNL286W 858 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YOR097CYOR097C 528 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 MPD1YOR288C 957 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SRL4YPL033C 846 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PWR1PWR1 941 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SRP72YPL210C 1923 nt4.32□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 OPT2YPR194C 2634 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SMP1YBR182C 1359 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 BCP1YDR361C 852 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 VPS20YMR077C 666 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YMR084WYMR084W 789 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 REX4YOL080C 870 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 CBP6YBR120C 489 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 KIC1YHR102W 3243 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 FAS2YPL231W 5664 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PUT2YHR037W 1728 nt4.31□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SAT4YCR008W 1812 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YJR026WYJR026W 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YJR028WYJR028W 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YAR010CYAR010C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YML040WYML040W 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YMR051CYMR051C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 CBS2YDR197W 1170 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 BMH1YER177W 804 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 RPS0AYGR214W 759 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 DPH1YIL103W 1278 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 NRK1YNL129W 723 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 MRM1YOR201C 1239 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SFG1YOR315W 1041 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 TAF3YPL011C 1062 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PBP2YBR233W 1242 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 GRX1YCL035C 333 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PBI1YPL272C 1554 nt4.3□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 VBA2YBR293W 1425 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SLS1YLR139C 1932 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 CUP1-1YHR053C 186 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 CUP1-2YHR055C 186 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 FSH3YOR280C 801 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 MUM2YBR057C 1101 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 MED8YBR193C 672 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 RRN11YML043C 1524 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PRM2YIL037C 1971 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 MAK11YKL021C 1407 nt4.29□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 PUS9YDL036C 1389 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 SAD1YFR005C 1347 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 BUD30YDL151C 582 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 COS7YDL248W 1152 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 COS5YJR161C 1152 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YLR049CYLR049C 1287 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YLR271WYLR271W 825 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 RUF5-1RUF5-1 710 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 RUF5-2RUF5-2 710 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 YPL114WYPL114W 420 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 IDS2YJL146W 1410 nt4.28□□□□□ -1.72
DSE3Q08729 FDC1YDR539W 1512 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 MCP2YLR253W 1710 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 KXD1YGL079W 657 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 LST7YGR057C 729 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 BNA1YJR025C 534 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 CMC1YKL137W 336 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 GAB1YLR459W 1185 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 IPP1YBR011C 864 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 YPR142CYPR142C 564 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 FMP30YPL103C 1407 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 ECM18YDR125C 1362 nt4.27□□□□□ -1.73
DSE3Q08729 ALG1YBR110W 1350 nt4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms