Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDR1Q08345 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDR1Q08345 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDR1Q08345 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDR1Q08345 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDR1Q08345 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DDR1Q08345 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.51■■■□□ 2
DDR1Q08345 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDR1Q08345 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DDR1Q08345 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDR1Q08345 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDR1Q08345 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms