Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPAQ06546 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABPAQ06546 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPAQ06546 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms