Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EXOSC9Q06265 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC9Q06265 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms