Protein–RNA interactions for Protein: Q06244

PUS5, 21S rRNA pseudouridine(2819) synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS5Q06244 PEX21YGR239C 867 nt6.52□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.52□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 POP3YNL282W 588 nt6.52□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YOR366WYOR366W 354 nt6.52□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 GRE1YPL223C 507 nt6.52□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 ARP4YJL081C 1470 nt6.52□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 VPS1YKR001C 2115 nt6.52□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 MSN4YKL062W 1893 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 PRM2YIL037C 1971 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 TAH11YJR046W 1815 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YER079WYER079W 633 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 RTT105YER104W 627 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 PCL7YIL050W 858 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YIL077CYIL077C 963 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 APS3YJL024C 585 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 SOP4YJL192C 705 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YOR012WYOR012W 414 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 ATG5YPL149W 885 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 DIT2YDR402C 1470 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 ORC4YPR162C 1590 nt6.51□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 ISC10YER180C 804 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YGL199CYGL199C 471 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 GIM5YML094W 492 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YMR087WYMR087W 855 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YAF9YNL107W 681 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 SUA7YPR086W 1038 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 RPO26YPR187W 468 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YBR124WYBR124W 360 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 RNT1YMR239C 1416 nt6.5□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YDL183CYDL183C 963 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YER158W-AYER158W-A 216 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 GRE3YHR104W 984 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YHR138CYHR138C 345 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YKE4YIL023C 1041 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 RPS30AYLR287C-A 192 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 CUZ1YNL155W 825 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 MRPL27YBR282W 441 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 DAS1YJL149W 1992 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 IMA3YIL172C 1770 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 IMA4YJL221C 1770 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 SRF1YDL133W 1314 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 POB3YML069W 1659 nt6.49□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 RXT3YDL076C 885 nt6.48□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 DJP1YIR004W 1299 nt6.48□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 GEP5YLR091W 882 nt6.48□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 CDC37YDR168W 1521 nt6.48□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 GGA1YDR358W 1674 nt6.48□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 ACA1YER045C 1470 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 KKQ8YKL168C 2175 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 FRS2YFL022C 1512 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 HIS7YBR248C 1659 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 FAU1YER183C 636 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 RME1YGR044C 903 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 RPP0YLR340W 939 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YSF3YNL138W-A 258 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 AIM39YOL053W 1188 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 BRX1YOL077C 876 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 TMA16YOR252W 537 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 ATG7YHR171W 1893 nt6.47□□□□□ -1.37
PUS5Q06244 YER068C-AYER068C-A 432 nt6.46□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 Q0143Q0143 153 nt6.46□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YJL169WYJL169W 369 nt6.46□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 SRP40YKR092C 1221 nt6.46□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt6.46□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 RRN9YMR270C 1098 nt6.46□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 THI20YOL055C 1656 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 GIT1YCR098C 1557 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 MAL12YGR292W 1755 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 MAL32YBR299W 1755 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YER145C-AYER145C-A 438 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 FUN19YAL034C 1242 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YBL010CYBL010C 843 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 PES4YFR023W 1836 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 LCB2YDR062W 1686 nt6.45□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YER087C-AYER087C-A 552 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 SPT2YER161C 1002 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 MAM33YIL070C 801 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 RPL16AYIL133C 600 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YIR042CYIR042C 711 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YLR125WYLR125W 411 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YLR171WYLR171W 390 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 ATG8YBL078C 354 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 RPA49YNL248C 1248 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 SYC1YOR179C 567 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 YPL088WYPL088W 1029 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 RPL5YPL131W 894 nt6.44□□□□□ -1.38
PUS5Q06244 CBC2YPL178W 627 nt6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.4 ms