Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 BAR1YIL015W 1764 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 DSD1YGL196W 1287 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YGL262WYGL262W 528 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YKL050CYKL050C 2769 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 RPS21AYKR057W 264 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YLR049CYLR049C 1287 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 VTA1YLR181C 993 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 SPO77YLR341W 1434 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 MUM3YOR298W 1440 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 POC4YPL144W 447 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YPL162CYPL162C 822 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 RGP1YDR137W 1992 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 ETP1YHL010C 1758 nt3.23□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 STU2YLR045C 2667 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YCR050CYCR050C 309 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YEL028WYEL028W 462 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 ECO1YFR027W 846 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YAR070CYAR070C 300 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 ELO3YLR372W 1038 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 TVP18YMR071C 504 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 NRG2YBR066C 663 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YPR150WYPR150W 522 nt3.22□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 PCL10YGL134W 1302 nt3.21□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 FLO9YAL063C 3969 nt3.21□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 APN2YBL019W 1563 nt3.21□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 YDR444WYDR444W 2064 nt3.21□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 VID27YNL212W 2349 nt3.21□□□□□ -1.89
NEJ1Q06148 ARG5,6YER069W 2592 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 PHO87YCR037C 2772 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 DPB4YDR121W 591 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 TRP4YDR354W 1143 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 USE1YGL098W 738 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 IGO2YHR132W-A 396 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 ISA2YPR067W 558 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 PRE2YPR103W 864 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 NAT3YPR131C 588 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 MEK1YOR351C 1494 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 ORC4YPR162C 1590 nt3.21□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 FUN12YAL035W 3009 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YLR345WYLR345W 1530 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 SEC6YIL068C 2418 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 NOP6YDL213C 678 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 COX18YGR062C 951 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 MRP13YGR084C 1020 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 PRM9YAR031W 897 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 RSF2YJR127C 4143 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YSP2YDR326C 4317 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 MDL1YLR188W 2088 nt3.2□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 SIP1YDR422C 2448 nt3.19□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YER085CYER085C 522 nt3.19□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 UTP11YKL099C 753 nt3.19□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 PTM1YKL039W 1572 nt3.19□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 IMD4YML056C 1575 nt3.19□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YMR018WYMR018W 1545 nt3.19□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YER067C-AYER067C-A 324 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YHR173CYHR173C 339 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 RPL17AYKL180W 555 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 COX19YLL018C-A 297 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YMR147WYMR147W 672 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 SUI3YPL237W 858 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 DIB1YPR082C 432 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 RAD4YER162C 2265 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 NUP60YAR002W 1620 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 SMI1YGR229C 1518 nt3.18□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 POL2YNL262W 6669 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 MGT1YDL200C 567 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 UBC8YEL012W 657 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 RSM25YIL093C 795 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 MRS3YJL133W 945 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 REE1YJL217W 597 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 SPC34YKR037C 888 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 ASI2YNL159C 870 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 DSC2YOL073C 969 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 CKS1YBR135W 453 nt3.17□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 SIZ1YDR409W 2715 nt3.16□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 PFA5YDR459C 1125 nt3.16□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 SNO1YMR095C 675 nt3.16□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 RPA135YPR010C 3612 nt3.16□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 GLC3YEL011W 2115 nt3.16□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 YAK1YJL141C 2424 nt3.15□□□□□ -1.9
NEJ1Q06148 DET1YDR051C 1005 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 ENT5YDR153C 1236 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RPS31YLR167W 459 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 FLD1YLR404W 858 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YOR342CYOR342C 960 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RET3YPL010W 570 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 CMD1YBR109C 444 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 PFK26YIL107C 2484 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 CLD1YGR110W 1338 nt3.15□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 GAS2YLR343W 1668 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 CSR2YPR030W 3366 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 QRI7YDL104C 1224 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YAL004WYAL004W 648 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 TPM1YNL079C 600 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RHO5YNL180C 996 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 RPC34YNR003C 954 nt3.14□□□□□ -1.91
NEJ1Q06148 COA2YPL189C-A 207 nt3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms