Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTK2Q05397 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms