Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CD164Q04900 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CD164Q04900 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CD164Q04900 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms