Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EMX2Q04743 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EMX2Q04743 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms