Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT17Q04695 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT17Q04695 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms