Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GBE1Q04446 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBE1Q04446 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms