Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ROM1Q03395 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ROM1Q03395 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ROM1Q03395 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms