Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF17Q02223 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TNFRSF17Q02223 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms