Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLCB3Q01970 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLCB3Q01970 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms