Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAP1Q01518 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAP1Q01518 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAP1Q01518 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms