Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDPQ00604 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDPQ00604 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDPQ00604 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDPQ00604 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDPQ00604 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDPQ00604 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDPQ00604 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDPQ00604 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDPQ00604 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDPQ00604 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDPQ00604 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms