Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDK3Q00526 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms